Mustafa Toprak 1964 yılında Erzincan'nda doğdu. Ankara Üniversitesi Siyasal Bilgiler Fakültesi İktisat Bölümü’nden mezun oldu. Emet Kaymakam vekilliği, İncesu, Taşlıçay, Ahlat Kaymakamlığı, Rize Vali Yardımcılığı, Mülkiye Müfettişliği, Devlet Bakanı Başdanışmanlığı, İçişleri Bakanlığı Genel Sekreterliği yapmıştır. Çorum ve Diyarbakır valiliklerinin ardından 3 Mayıs 2013 tarihli atama kararıyla İzmir Valiliğine atanmıştır. 1 Haziran 2016 tarihinde Resmi Gazete'de yayımlanan Valiler Kararnamesi ile Malatya Valiliğine atanmıştır. 21 Haziran 2017 tarihinde Resmi Gazete'de yayımlanan valiler kararnamesi ile Merkez Valiliği görevine getirilmiştir. Evli ve 2 çocuk babasıdır.